L’histoire suit Suzuko, une lycéenne de dix-sept ans vivant dans le Japon moderne, qui garde des souvenirs fragmentés d’un incendie survenu durant son enfance. Un jour, alors qu’elle rentre chez elle avec Shûhei, un jeune garçon récemment opéré de l’appendicite, une explosion de gaz les projette mystérieusement à l’époque Sengoku. Suzuko se réveille sur un champ de bataille, où elle est sauvée d'une tentative de viol par Shukumaru, un jeune homme venu chercher des provisions pour son village.
Shukumaru l’accueille chez lui, où elle rencontre sa petite sœur, Suzu. Malgré son caractère possessif et son manque de manières, il se montre protecteur et souhaite l’épouser. Suzuko, cependant, cherche désespérément Shûhei, dont elle retrouve une chemise parmi les affaires des villageois. Au fil de leurs recherches - qui s'avèrent infructueuses - pour retrouver le petit garçon, elle développe des sentiments pour Shukumaru, tiraillée entre son désir de retrouver son époque et son attachement grandissant à lui.

Le mystère s’éclaircit lorsque Suzuko reconnaît chez Suzu une cloche liée à ses souvenirs. Elle découvre finalement qu’elle était autrefois cette petite fille, qui vivait dans le village avant qu’il ne soit attaqué par les pillards d’Akauma. Prisonnière d’une maison en flammes, elle avait mystérieusement été transportée dans le Japon moderne, où elle avait été adoptée et élevée sous le nom de Suzuko. Cette révélation explique ses souvenirs d’enfance, mais soulève une inquiétude : Shukumaru étant le frère de Suzu, Suzuko craint d’être amoureuse de son propre frère !
Lorsque les pillards attaquent de nouveau et que Shukumaru est gravement menacé, Suzuko le rejoint. Les flammes provoquent un nouveau déplacement temporel qui les transporte dans le Japon moderne. En soignant Shukumaru, elle découvre une cicatrice correspondant à celle de l’appendicectomie de Shûhei. Elle comprend alors qu’ils sont une seule et même personne : lors de l’explosion initiale, Suzuko et Sûhei ont été séparés dans le temps. Tandis qu’elle a rejoint le monde moderne, Shûhei est arrivé dans le Japon féodal, où il a grandi sous le nom de Shukumaru. Il n’est donc pas son frère biologique, et leur amour n’est pas interdit.

Libérés de leurs doutes, les deux jeunes gens choisissent leur avenir ensemble. Shukumaru souhaite rester à l’époque Sengoku, où il a grandi, et Suzuko accepte de le suivre. Profitant du phénomène temporel lié à l’explosion initiale de gaz, ils retournent ensemble dans le passé. L’OAV se termine sur une note romantique et optimiste, évoquant une vie qu'ils vont construire ensemble...
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